Ο Κωνσταντίνος Μιχαλάκης αποφοίτησε από την Οδοντιατρική Σχολή του Αριστοτελείου Πανεπιστημίου Θεσσαλονίκης το 1989. Το 1990 ξεκίνησε την ειδικότητα της Προσθετικής στην Οδοντιατρική Σχολή του Πανεπιστημίου TUFTS στη Βοστώνη των Η.Π.Α., απ’ όπου και αποφοίτησε το 1993. Το 1994 ξεκίνησε να εργάζεται στο ιδιωτικό του ιατρείο στη Θεσσαλονίκη, ασχολούμενος αποκλειστικά με το αντικείμενο της ειδικότητάς του. Το 2001 αναγορεύθηκε διδάκτορας της Οδοντιατρικής Σχολής του Αριστοτελείου Πανεπιστημίου Θεσσαλονίκης. Το 2004 του απενεμήθη, μετά από γραπτές και προφορικές εξετάσεις, το δίπλωμα της Αμερικανικής Επιτροπής Προσθετικής (Diplomate of the American Board of Prosthodontics). Το 2008 έλαβε τον τίτλο Master of Science σε Εφηρμοσμένη Εμβιομηχανική από το Πολυτεχνείο του Πανεπιστημίου του Strathclyde, του Ηνωμένου Βασιλείου. Το 2016 ολοκλήρωσε το πρόγραμμα Διοίκησης Οργανισμών Υγείας του Πανεπιστημίου Cornell, των Η.Π.Α. Το 2018 ξεκίνησε το πρόγραμμα Master of Science in Experimental and Translational Research and Therapeutics (εφαρμογή βασικής έρευνας σε κλινικές μελέτες) στο Πανεπιστήμιο της Οξφόρδης, στο Ηνωμένο Βασίλειο. Έχει δώσει πολλές διαλέξεις σε συνέδρια στην Ελλάδα και στο εξωτερικό, ενώ έχει γράψει πολλά άρθρα τόσο σε ελληνικά όσο και ξένα έγκυρα επιστημονικά περιοδικά, πάνω σε θέματα της ειδικότητάς του. Σήμερα είναι αναπληρωτής καθηγητής και διευθυντής του μεταπτυχιακού προγράμματος Προσθετικής στο Αριστοτέλειο Πανεπιστήμιο Θεσσαλονίκης και επισκέπτης αναπληρωτής καθηγητής στο Πανεπιστήμιο TUFTS. Είναι μέλος του American College of Prosthodontists, του International College of Prosthodontists, της American Academy of Fixed Prosthodontics, της Academy of Prosthodontics, της European Association for Osseointegration, του European Society of Biomechanics και άλλων επιστημονικών εταιρειών.
